軍事法庭為一層樓建物，樓地板面積為53.2坪，為警備總部軍法處1967年遷入時所興建，由當時軍法處所屬工程隊施工。軍事法庭內有三間法庭，中間法庭較大，另有兩間小法庭。當時在這裡開庭審訊的案件都是不對外公開的秘密審判，每當政治犯遭逮捕後，皆經警總保安處、調查局或憲警單位偵訊後送來此地審判。軍法審判是二審制，判死刑者會立刻被加上腳鐐送回押房，等候送往安坑刑場執行槍決。
